Esto es un pantallazo de Piklab donde se muestra un problema de permisos con el puerto serial, no entraremos en detalles ya que si usan GNU-Linux es un tema muy comun en nuestra comunidad solo pondre el comando para que puedan trabajar con el JDM tiene que ser en una terminal y en modo root si tu gestor de ventanas es KDE piklab tiene una pestaña en la parte inferior del programa para abrir una terminal en el mismo programa pero como yo uso GNOME tengo que abrir una terminal por medio del menu.
chmod 0666 /dev/ttyS0
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